More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4285 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.78 
 
 
225 aa  341  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 
261 aa  340  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  75 
 
 
225 aa  338  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  75.22 
 
 
229 aa  337  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  75.22 
 
 
229 aa  336  2e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.23 
 
 
223 aa  331  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.89 
 
 
225 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  75.78 
 
 
225 aa  328  6e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  72.2 
 
 
226 aa  327  1e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  71.62 
 
 
224 aa  326  2e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  75.89 
 
 
225 aa  325  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.62 
 
 
224 aa  325  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.43 
 
 
226 aa  325  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  77.58 
 
 
225 aa  325  4e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.82 
 
 
227 aa  323  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.68 
 
 
225 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  77.03 
 
 
225 aa  322  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.87 
 
 
225 aa  321  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  75.34 
 
 
225 aa  319  2e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  70.51 
 
 
248 aa  315  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  75 
 
 
228 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  75 
 
 
228 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  75 
 
 
228 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  73.66 
 
 
228 aa  313  1e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.42 
 
 
227 aa  312  3e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  6.3533e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  74.11 
 
 
228 aa  311  4e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  73.66 
 
 
228 aa  311  6e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.82 
 
 
227 aa  309  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.89 
 
 
229 aa  308  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.13 
 
 
239 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.2 
 
 
228 aa  301  5e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.4 
 
 
228 aa  301  7e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.06 
 
 
231 aa  296  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  52.34 
 
 
240 aa  235  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  47.98 
 
 
256 aa  218  8e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  50.22 
 
 
228 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
230 aa  213  2e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
228 aa  211  6e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
235 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
230 aa  211  8e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
233 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  48.66 
 
 
233 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  50.91 
 
 
225 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
235 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 
233 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 
242 aa  209  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.75 
 
 
226 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  49.12 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
228 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
228 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.92e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
245 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 
247 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
228 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
231 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  49.55 
 
 
230 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
245 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
226 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
228 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
232 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  48.87 
 
 
227 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 
229 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
229 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 
226 aa  204  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  49.11 
 
 
229 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 
223 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.58 
 
 
229 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 
236 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 
225 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 
234 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
237 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
228 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.28008e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
231 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
232 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  45.92 
 
 
237 aa  201  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 
237 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 
226 aa  200  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 
226 aa  201  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.89 
 
 
235 aa  201  1e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 
226 aa  199  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 
237 aa  200  2e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 
238 aa  199  2e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  45.69 
 
 
248 aa  199  2e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 
237 aa  199  2e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
233 aa  200  2e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
248 aa  199  2e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
226 aa  200  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
247 aa  200  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
242 aa  199  4e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>