More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4284 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 581 aa  1138    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  48.16 
 
 		 608 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  50.75 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.28 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.37 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  48.93 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 		 552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  52.36 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  49.9 
 
 		 594 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  52.32 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  49.52 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.27 
 
 		 551 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  48.93 
 
 		 554 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  47.28 
 
 		 579 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  50.19 
 
 		 801 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 		 605 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  45.9 
 
 		 597 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 601 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  46.89 
 
 		 544 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 574 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.02 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  45.55 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  46 
 
 		 587 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  45.22 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  53.91 
 
 		 558 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 607 aa  350  5e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 572 aa  333  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 565 aa  282  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  36.79 
 
 		 505 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.08 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  33.33 
 
 		 482 aa  193  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.16 
 
 		 468 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.44 
 
 		 518 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.95 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.45 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.8 
 
 		 463 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 613 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  34.06 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.44 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  36.3 
 
 		 594 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.06 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.22 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 723 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 371 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.65 
 
 		 449 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 359 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  36.36 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.33 
 
 		 364 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.33 
 
 		 364 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.9 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 500 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.66 
 
 		 423 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 471 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  26.89 
 
 		 471 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  34.65 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 		 1119 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.02 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.38 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.09 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.92 
 
 		 464 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.14 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.14 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 480 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25.37 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.54 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>