More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4194 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  993    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  63.52 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  54.42 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.29 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  47.8 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  47.46 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  46.49 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.8 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  47.24 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  47.02 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 470 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  49.33 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  46.17 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.67 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.8 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.45 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.91 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.45 
 
 		 456 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.23 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.23 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  47.46 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  46.05 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  48.46 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  43.39 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  45.43 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  44.81 
 
 		 463 aa  392  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  44.88 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  42.2 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  44.62 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  41.69 
 
 		 455 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.79 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  42.09 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.88 
 
 		 455 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  45.31 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.44 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  41.69 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.7 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  39.78 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  39.78 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  42.7 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  43.11 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.44 
 
 		 454 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.69 
 
 		 511 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  43.11 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  43.43 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  40.76 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.65 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  41.65 
 
 		 461 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.65 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.65 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  40.31 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  42.06 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  40.48 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  46.21 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 469 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>