195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4151 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  59.92 
 
 
304 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  52.75 
 
 
316 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  54.33 
 
 
336 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  53.92 
 
 
317 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  49.01 
 
 
317 aa  255  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  52.6 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  50.83 
 
 
310 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  51.8 
 
 
316 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  50.7 
 
 
304 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  58.14 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  51.76 
 
 
315 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  51.49 
 
 
305 aa  235  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  52.77 
 
 
309 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  51.35 
 
 
310 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  45.28 
 
 
320 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  49.35 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  45.92 
 
 
336 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  50 
 
 
291 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  51.89 
 
 
328 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  50.84 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  50.51 
 
 
300 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  47.9 
 
 
330 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  52.06 
 
 
317 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  51.74 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  49.63 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  52.81 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  50 
 
 
315 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  42.8 
 
 
300 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  49.82 
 
 
314 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  41.31 
 
 
297 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  37.26 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  37.68 
 
 
355 aa  182  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  49.62 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  49.62 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  42.21 
 
 
301 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  49.61 
 
 
316 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  35.79 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  48.63 
 
 
314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  36.58 
 
 
307 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  34.56 
 
 
308 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  40.44 
 
 
305 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3723  homoserine kinase  41.23 
 
 
389 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422816  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  40.07 
 
 
305 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  38.35 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  44 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  46.15 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  43.38 
 
 
306 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  41.92 
 
 
302 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  40 
 
 
314 aa  159  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  39.45 
 
 
296 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  34.56 
 
 
303 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  42.07 
 
 
304 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  39.33 
 
 
303 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  34.22 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  37.12 
 
 
304 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.15 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  39.67 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  41.89 
 
 
310 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  29.8 
 
 
293 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  31.84 
 
 
292 aa  136  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  39.42 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  39.58 
 
 
307 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.23 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.69 
 
 
315 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.69 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  31.47 
 
 
292 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  31.47 
 
 
292 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  31.42 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  31.47 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  39.05 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  34.21 
 
 
426 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  30.88 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  29.57 
 
 
300 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  29.74 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  38.13 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  35.26 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  31.42 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  36.74 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  41.64 
 
 
323 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.97 
 
 
315 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  29.53 
 
 
293 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.97 
 
 
315 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  33.21 
 
 
302 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  28.47 
 
 
294 aa  123  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  32.78 
 
 
292 aa  123  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  40.91 
 
 
290 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  31.79 
 
 
300 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  37.92 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  42.05 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.33 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  34.5 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  33.08 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  33.08 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.29 
 
 
304 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.29 
 
 
304 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  33.58 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  33.71 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  33.46 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  33.46 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>