286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4140 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  59.54 
 
 		 181 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  63.28 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  59.88 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  56.47 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  57.3 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  52.38 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  49.43 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  60.36 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  53.89 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  52.63 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  51.45 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  45.29 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.26 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  49.12 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  50.3 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  45.71 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  48.78 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  43.43 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  44.64 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  47.59 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  45.34 
 
 		 179 aa  124  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  47.73 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  35.93 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  38.37 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  38.51 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.93 
 
 		 443 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.93 
 
 		 443 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.93 
 
 		 443 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.4 
 
 		 448 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  40.12 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  42.01 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  27.44 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.48 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.67 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.11 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.82 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.74 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.72 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.45 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.7 
 
 		 449 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  31.97 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  34.76 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>