More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4064 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  411  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  48.34 
 
 		 218 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.82 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.46 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  54.25 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 224 aa  194  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  48.6 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.22 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  45.37 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.89 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  50 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 237 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  46.48 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 241 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.87 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  49.53 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  53.59 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.76 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.78 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.19 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.36 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.71 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.19 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  47.87 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.05 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 227 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  48.13 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.58 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.95 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>