32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4049 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  100 
 
 		 215 aa  397  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  52.91 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  48.08 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  55.45 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  48.79 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  47.78 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  49.76 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  46.67 
 
 		 292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  50.29 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  44.55 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  55.07 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  55.07 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  46.63 
 
 		 222 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  46.15 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  49.52 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  45.85 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  59.23 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  43.15 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  42.37 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  46.26 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  45.5 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  48.53 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  43.69 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  40.45 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  37.7 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.98 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.23 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  26.7 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  32.18 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 725 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>