More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3967 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  100 
 
 		 524 aa  1015    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  68.35 
 
 		 337 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  66.38 
 
 		 348 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  64.73 
 
 		 336 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  64.41 
 
 		 347 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  63.33 
 
 		 340 aa  302  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  63.98 
 
 		 347 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  62.92 
 
 		 333 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  64.41 
 
 		 348 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  61.6 
 
 		 347 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  60.83 
 
 		 353 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  59.58 
 
 		 347 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  59.58 
 
 		 347 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  59.58 
 
 		 347 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  59.58 
 
 		 347 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  58.65 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  59.49 
 
 		 361 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  59.75 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  61.11 
 
 		 351 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  59.66 
 
 		 329 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  58.65 
 
 		 333 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  59.07 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  62.27 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  57.98 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  56.36 
 
 		 331 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  61.47 
 
 		 337 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  56.96 
 
 		 328 aa  253  9.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  55.73 
 
 		 364 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  53.71 
 
 		 326 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  60 
 
 		 339 aa  247  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  51.7 
 
 		 365 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  55.02 
 
 		 328 aa  244  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  53.71 
 
 		 326 aa  243  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  55.65 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  51.65 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  52.3 
 
 		 354 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  51.38 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  48.56 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  45.8 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  46.22 
 
 		 384 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  47.54 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  46.48 
 
 		 362 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  45.27 
 
 		 381 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  46.52 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  44.63 
 
 		 346 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  47.54 
 
 		 359 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  45.12 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 		 355 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  43.72 
 
 		 360 aa  200  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  44.26 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  45.08 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 		 378 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  46.22 
 
 		 382 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  44.49 
 
 		 366 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  47.96 
 
 		 381 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  45.15 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  45.15 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  44.31 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  45.57 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  43.93 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  38.55 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  41.74 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  43.04 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  43.04 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  43.15 
 
 		 369 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  41.74 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 366 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 366 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0957  NusA antitermination factor  39.43 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  41.84 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  41.42 
 
 		 442 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  39.33 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  38.84 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  39.15 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  43.16 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  41.03 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.92 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  40.93 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  41.7 
 
 		 372 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  39.58 
 
 		 401 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  41.13 
 
 		 537 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  41.13 
 
 		 537 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  38.37 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  39.57 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  41.13 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  39.58 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  40.25 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  40.25 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>