More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3831 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  100 
 
 		 296 aa  557  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  60.47 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3029  inner-membrane translocator  60.47 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0758  inner-membrane translocator  61.15 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.244224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1464  inner-membrane translocator  60.47 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  34.01 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.89 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  33 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.98 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.12 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  37.04 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.23 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.12 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.2 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.58 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.36 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2081  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  32.24 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  32.59 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>