More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3794 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 234 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.14 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 214 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.31 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 293 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  30.73 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  21.57 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.18 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  25.79 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>