64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3704 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 322 aa  635    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.75 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.12 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.12 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.44 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2623  hypothetical protein  65.38 
 
 		 87 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000200416  hitchhiker  0.00624491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.59 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  22.15 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  26 
 
 		 1076 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.1 
 
 		 437 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  23.64 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 1073 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 788 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.58 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.51 
 
 		 788 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.15 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.25 
 
 		 788 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  24.13 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.31 
 
 		 790 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.95 
 
 		 788 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  23.84 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.36 
 
 		 788 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.08 
 
 		 788 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.3 
 
 		 460 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.22 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.95 
 
 		 788 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.08 
 
 		 583 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.47 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.66 
 
 		 788 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  24.62 
 
 		 802 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.14 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.84 
 
 		 788 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 647 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  23.42 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.39 
 
 		 598 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  23.87 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.63 
 
 		 1795 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1518  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000454364  hitchhiker  0.00000000880332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.76 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.37 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  25.34 
 
 		 795 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3390  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.6 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.854507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.35 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.02 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.58 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 810 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>