51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3663 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  60.13 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  63.4 
 
 		 153 aa  183  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  61.44 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  62.09 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  61.74 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  61.74 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  61.74 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  59.21 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  59.48 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  56.29 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  58.17 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 		 174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 		 152 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  59.73 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  54.73 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 324 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  50.67 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  58.17 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 		 164 aa  141  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  45.45 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.55 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  52.12 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.67 
 
 		 167 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  33.91 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  32.81 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>