More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3605 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  67.84 
 
 
737 aa  868  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  71.73 
 
 
777 aa  945  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  51.54 
 
 
819 aa  681  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  70.6 
 
 
760 aa  952  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  55.47 
 
 
739 aa  667  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  67.26 
 
 
782 aa  920  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  70.6 
 
 
760 aa  952  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  66.71 
 
 
739 aa  808  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  71.52 
 
 
764 aa  937  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  73.63 
 
 
769 aa  972  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  67.84 
 
 
737 aa  868  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  72.13 
 
 
755 aa  1009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  71.37 
 
 
768 aa  910  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  60.4 
 
 
850 aa  833  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  67.29 
 
 
785 aa  864  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  76.02 
 
 
764 aa  942  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  72.36 
 
 
785 aa  902  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  67.8 
 
 
810 aa  890  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  64.24 
 
 
867 aa  884  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  71.22 
 
 
773 aa  924  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
743 aa  652  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  56.32 
 
 
779 aa  717  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  51.96 
 
 
761 aa  637  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  67.02 
 
 
795 aa  862  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  58.66 
 
 
770 aa  690  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  77.61 
 
 
763 aa  968  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  70.25 
 
 
760 aa  919  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  57.74 
 
 
810 aa  758  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  71.97 
 
 
757 aa  1004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 
798 aa  638  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  75.72 
 
 
737 aa  958  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  72.13 
 
 
766 aa  1008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  74.63 
 
 
792 aa  1035  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  68.67 
 
 
733 aa  906  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  70.53 
 
 
761 aa  988  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  66.96 
 
 
782 aa  922  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  56.68 
 
 
868 aa  707  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  69.22 
 
 
769 aa  914  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  67.84 
 
 
737 aa  868  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  68.66 
 
 
749 aa  921  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  70.73 
 
 
745 aa  917  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  67.26 
 
 
782 aa  919  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
765 aa  1474  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  76.79 
 
 
762 aa  996  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  74.66 
 
 
737 aa  936  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  66.93 
 
 
785 aa  905  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  67.02 
 
 
785 aa  904  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  66.09 
 
 
750 aa  885  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  78.91 
 
 
752 aa  978  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  75.44 
 
 
764 aa  920  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  56.76 
 
 
847 aa  740  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  75.64 
 
 
746 aa  1058  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  76.49 
 
 
745 aa  1015  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  65.99 
 
 
758 aa  862  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
815 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
797 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  44.52 
 
 
805 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  49.53 
 
 
754 aa  618  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
802 aa  614  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
802 aa  614  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
806 aa  614  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  3.37327e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  52.18 
 
 
751 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
806 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.85 
 
 
803 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  44.16 
 
 
805 aa  608  1e-172  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  44.03 
 
 
805 aa  606  1e-172  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  44.03 
 
 
805 aa  606  1e-172  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.48263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  44.16 
 
 
805 aa  608  1e-172  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97644e-14 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
786 aa  608  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  56.22 
 
 
792 aa  602  1e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  44.12 
 
 
805 aa  603  1e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.16421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.12 
 
 
805 aa  605  1e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.81926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
798 aa  603  1e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.59 
 
 
794 aa  605  1e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
806 aa  604  1e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
837 aa  602  1e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
798 aa  603  1e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
796 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  51.14 
 
 
752 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
753 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  42.43 
 
 
797 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
889 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
821 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.48 
 
 
799 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
889 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
818 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
866 aa  578  1e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.34074e-09  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 
752 aa  573  1e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
750 aa  575  1e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
759 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.04 
 
 
831 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
817 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
759 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
1071 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  40.53 
 
 
828 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.69 
 
 
836 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
758 aa  564  1e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
836 aa  563  1e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
1087 aa  565  1e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
836 aa  564  1e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>