24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3560 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  57.59 
 
 
194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  59.43 
 
 
193 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  53.68 
 
 
191 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  58.99 
 
 
193 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  58.99 
 
 
193 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  58.99 
 
 
193 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  56.57 
 
 
194 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  54.89 
 
 
195 aa  198  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  59.65 
 
 
193 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  55.37 
 
 
223 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  59.3 
 
 
194 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  60.24 
 
 
197 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  57.46 
 
 
193 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  59.43 
 
 
195 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  57.89 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  55.62 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  54.29 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  51.09 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  51.7 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  52.69 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  49.43 
 
 
194 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  45.76 
 
 
195 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  41.98 
 
 
183 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>