More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3558 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  100 
 
 		 287 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  46.94 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  45.92 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  47.42 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  43.3 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  45.42 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  43.2 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  44.22 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  41.5 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  47.06 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  46.76 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  44.41 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  46.86 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  38.36 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  46.42 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  37.88 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  39.93 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  43.1 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  38.23 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  36.27 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  37.15 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  34.21 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  37.41 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  27.7 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  34.02 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.77 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  30.27 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.81 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.43 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  37.11 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  36.27 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  36.64 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  36.73 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.86 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  28.91 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  28.91 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  28.91 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  28.91 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  28.91 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  30.79 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  33.79 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  42.06 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  38.08 
 
 		 344 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.96 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  34.14 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  38.85 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  35.93 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  35.74 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  38.02 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  32.62 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.86 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  29.96 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  36.86 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  33.75 
 
 		 339 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  31.06 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  35.74 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  31.89 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  35.74 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 315 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.9 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  34.33 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  32.08 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  34.11 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  35.5 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.11 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.76 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  31.23 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.76 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  35.5 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  31.75 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33.83 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  32.71 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  35.45 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  31.75 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  31.75 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.79 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  35.25 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  32.71 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  34.67 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  31.75 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  34.35 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  37.93 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  36.36 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  35.47 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  36.36 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  34.45 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>