More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3469 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
304 aa  587  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 
329 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 
303 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.59 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 
352 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
344 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
366 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
327 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  31.85 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
421 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.87 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
303 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.55 
 
 
330 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  29.96 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  30.07 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  30.69 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.24 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.13 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  29.39 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.24 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  24.59 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.18 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.34 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.14 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2866  hypothetical protein  39.04 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.219006  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.2 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  23.08 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  23.47 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  25.76 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  27.08 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.26 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  29.8 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.05 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.54 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.4 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.31 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.28 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.2 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.84 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  27.76 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.59 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.81 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>