217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3444 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1308 aa  2621    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  38.47 
 
 
1392 aa  331  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  41.39 
 
 
1073 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 
1711 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.96 
 
 
1760 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 
1236 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 
1344 aa  241  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 
1334 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 
1686 aa  238  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.29 
 
 
1599 aa  237  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
1553 aa  236  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  27.46 
 
 
1699 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 
1481 aa  233  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 
1510 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27 
 
 
1598 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
1078 aa  223  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.9 
 
 
1609 aa  218  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.4 
 
 
1547 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.13 
 
 
1583 aa  210  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.21 
 
 
1823 aa  209  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.23 
 
 
1357 aa  209  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.15 
 
 
1190 aa  209  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.79 
 
 
1398 aa  204  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
972 aa  204  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 
1240 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 
1626 aa  202  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.42 
 
 
1733 aa  202  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
973 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  31.6 
 
 
1265 aa  196  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 
1491 aa  195  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  32.68 
 
 
1152 aa  195  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  31.55 
 
 
1157 aa  192  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.3 
 
 
1607 aa  188  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.58 
 
 
1657 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 
901 aa  184  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
969 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
969 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.87 
 
 
1230 aa  181  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
897 aa  178  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.69 
 
 
1617 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
1013 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
965 aa  174  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
1032 aa  174  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
1046 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 
1684 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.83 
 
 
1623 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.59 
 
 
1194 aa  158  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  28.76 
 
 
902 aa  155  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 
885 aa  154  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.54 
 
 
1399 aa  152  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  27.14 
 
 
1026 aa  151  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
1353 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
1085 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
1005 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.55 
 
 
1267 aa  143  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  30.02 
 
 
1014 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
1020 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.19 
 
 
1355 aa  140  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
947 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.84 
 
 
239 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411546  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.5 
 
 
1217 aa  119  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.08 
 
 
1075 aa  119  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  26.64 
 
 
1124 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  26.52 
 
 
1080 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1314 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  26.57 
 
 
1075 aa  116  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.69 
 
 
1063 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 
1401 aa  116  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  28.67 
 
 
1301 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  26.69 
 
 
1092 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  25.88 
 
 
1089 aa  112  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.87 
 
 
919 aa  111  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  29.12 
 
 
1074 aa  111  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  25.68 
 
 
1075 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  25.68 
 
 
1067 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  25.58 
 
 
1089 aa  109  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.97 
 
 
1190 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  28.93 
 
 
787 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  24.47 
 
 
1432 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 
1789 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  23.91 
 
 
1102 aa  101  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.86 
 
 
1163 aa  98.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 
1656 aa  98.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 
1229 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  25.14 
 
 
1131 aa  94  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  24.19 
 
 
1092 aa  94  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.43 
 
 
1256 aa  93.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.96 
 
 
1242 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  21.61 
 
 
1264 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  21.61 
 
 
1264 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.6 
 
 
1363 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.44 
 
 
1348 aa  85.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 
696 aa  85.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 
1367 aa  85.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1733  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.55 
 
 
643 aa  84.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.1 
 
 
924 aa  83.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.67 
 
 
1652 aa  82.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.54 
 
 
1161 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.54 
 
 
1161 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.05 
 
 
1211 aa  78.2  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>