130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3415 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
130 aa  261  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  35.61 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  37.69 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  33.04 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  30.25 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  34.38 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  31.62 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 
283 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  32.84 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  31.94 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  33.12 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.79 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.89 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
135 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  27.64 
 
 
133 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
181 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  23.73 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  22.88 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  28.57 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  29.84 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  24.56 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
133 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  27.05 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>