12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3346 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  30.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  30.16 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  32.76 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  32.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>