More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3330 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  56.35 
 
 		 601 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  56.38 
 
 		 597 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  57.99 
 
 		 605 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  56 
 
 		 593 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  55.02 
 
 		 598 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 616 aa  1233    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  58.76 
 
 		 599 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.11 
 
 		 597 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  55.39 
 
 		 595 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  55.69 
 
 		 597 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  53.81 
 
 		 601 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  55.07 
 
 		 607 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  55.69 
 
 		 597 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  59.33 
 
 		 599 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  58.6 
 
 		 599 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  57.05 
 
 		 606 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  59.87 
 
 		 602 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  59.67 
 
 		 600 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  55.69 
 
 		 597 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  54.92 
 
 		 599 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  55.72 
 
 		 602 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  54 
 
 		 600 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  55.68 
 
 		 615 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  53.01 
 
 		 600 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  55.83 
 
 		 606 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  54.44 
 
 		 604 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  54.62 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 		 604 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  53.19 
 
 		 619 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  54.42 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  53.83 
 
 		 602 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  54.59 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  53.85 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  55.44 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  55.2 
 
 		 606 aa  611  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  55.07 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  51.13 
 
 		 615 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  53.24 
 
 		 603 aa  596  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  53.42 
 
 		 599 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  55.09 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  52.42 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  55.17 
 
 		 622 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 		 597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 		 597 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  50.98 
 
 		 612 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  49.75 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  49.38 
 
 		 632 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.78 
 
 		 611 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  49.4 
 
 		 606 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  47.87 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  49.02 
 
 		 609 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  47.06 
 
 		 612 aa  495  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  43.22 
 
 		 618 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  42.21 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  39.94 
 
 		 679 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 590 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  40.07 
 
 		 682 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 677 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  38.17 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.03 
 
 		 622 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 		 602 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  39.9 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 604 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 604 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 606 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 635 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 606 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 597 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 609 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 612 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 610 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 592 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 607 aa  353  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 590 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.48 
 
 		 610 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 613 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 		 633 aa  347  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.73 
 
 		 610 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 633 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 616 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 592 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 598 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.42 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.05 
 
 		 587 aa  336  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 590 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 620 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>