228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3293 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
216 aa  433  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  61.03 
 
 
199 aa  235  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.38 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  39.47 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  39.47 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  38.95 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  37.91 
 
 
210 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  41.44 
 
 
200 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  38.12 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  36.55 
 
 
205 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  39.13 
 
 
221 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.94 
 
 
197 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  40.43 
 
 
209 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  39.25 
 
 
209 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  37.04 
 
 
211 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  34.04 
 
 
196 aa  121  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  35 
 
 
216 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  38.3 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  39.39 
 
 
207 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
194 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  33.67 
 
 
212 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  42.5 
 
 
184 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  36.93 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  40.72 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.69 
 
 
209 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  40.54 
 
 
207 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  35.53 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  36.18 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  36.18 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  40.33 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  37.85 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  36.36 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  35.86 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  37.16 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  36.41 
 
 
205 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  34.95 
 
 
200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  38.24 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  35.45 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.1 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.45 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  32.5 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  36.96 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  37.1 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  39.23 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  34 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  32.16 
 
 
206 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  37.43 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.1 
 
 
203 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  35.93 
 
 
205 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  34.65 
 
 
207 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  36.65 
 
 
218 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  39.47 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  39.27 
 
 
202 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  36.18 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  37.35 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  34.81 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.88 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  38.32 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  32.6 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  38.95 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  34.07 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  33.84 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  34.43 
 
 
201 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  37.72 
 
 
230 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.98 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  36.13 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.66 
 
 
223 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  36.78 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  38.82 
 
 
208 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.6 
 
 
203 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  37.3 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  34.55 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  36.53 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  33.17 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  36.53 
 
 
207 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.21 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  31.47 
 
 
203 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  31.47 
 
 
203 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  36.61 
 
 
202 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 
209 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 
209 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.83 
 
 
203 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  35.08 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  41.18 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  32.83 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  32.83 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>