158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3180 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  66.67 
 
 
202 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  69.23 
 
 
201 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  65.67 
 
 
219 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  64.1 
 
 
210 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  63.13 
 
 
201 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  66.5 
 
 
204 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  65.2 
 
 
207 aa  248  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  66.67 
 
 
201 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  66.34 
 
 
203 aa  246  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  65.31 
 
 
200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  65.52 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  62.8 
 
 
212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  67.51 
 
 
207 aa  241  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  63.54 
 
 
204 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  64.32 
 
 
196 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  64.1 
 
 
201 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  64.18 
 
 
196 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  65.82 
 
 
206 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  65.82 
 
 
206 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  60.66 
 
 
213 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  65.31 
 
 
206 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  65.13 
 
 
199 aa  234  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  64.95 
 
 
195 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  60.2 
 
 
201 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  59.11 
 
 
211 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  64.47 
 
 
198 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.5 
 
 
236 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  59.28 
 
 
203 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.13 
 
 
236 aa  215  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.13 
 
 
195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  55.1 
 
 
196 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.82 
 
 
195 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  52.82 
 
 
195 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.76 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  51.58 
 
 
190 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  53.61 
 
 
190 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  52.63 
 
 
191 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  48.69 
 
 
189 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.36 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.43 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.92 
 
 
188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  50.26 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  50.52 
 
 
194 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  48.19 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.25 
 
 
201 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  51.3 
 
 
198 aa  181  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.19 
 
 
196 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.19 
 
 
196 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  53.12 
 
 
191 aa  177  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.11 
 
 
192 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.7 
 
 
196 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.92 
 
 
196 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.56 
 
 
188 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.56 
 
 
188 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  47.4 
 
 
190 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.3 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.44 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.56 
 
 
187 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
196 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  43.68 
 
 
189 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.7 
 
 
196 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.7 
 
 
196 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  50.24 
 
 
208 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  44.44 
 
 
191 aa  166  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  49.21 
 
 
195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.56 
 
 
186 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.08 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.08 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  46.73 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  48.17 
 
 
204 aa  161  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
186 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.73 
 
 
198 aa  158  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  40.1 
 
 
192 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.19 
 
 
192 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.45 
 
 
189 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  43 
 
 
197 aa  157  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  38.22 
 
 
188 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  39.41 
 
 
205 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  41.27 
 
 
190 aa  156  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1220  SNO glutamine amidotransferase  52.6 
 
 
212 aa  154  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.04 
 
 
199 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  42.08 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.69 
 
 
200 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.01 
 
 
199 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.67 
 
 
192 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1409  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.21 
 
 
192 aa  148  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.794168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.22 
 
 
197 aa  147  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  36.63 
 
 
200 aa  147  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3479  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.59 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.31232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.43 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.62 
 
 
204 aa  145  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  45.6 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.9 
 
 
197 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  40.93 
 
 
189 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>