More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3179 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  79.52 
 
 		 252 aa  407  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  77.51 
 
 		 251 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  77.6 
 
 		 249 aa  400  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  77.6 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  77.2 
 
 		 249 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  78.4 
 
 		 249 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  77.11 
 
 		 251 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  77.51 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  78.31 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  78.31 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  78.31 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  78.54 
 
 		 253 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  77.51 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  74.3 
 
 		 250 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  75.9 
 
 		 252 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  74.21 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  75.1 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  76.42 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  77.14 
 
 		 251 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  77.11 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  72.69 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  78.31 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  75.1 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  75.9 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  73.47 
 
 		 252 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  71.89 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  70 
 
 		 251 aa  358  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  68.87 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  69.48 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  71.43 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  67.47 
 
 		 251 aa  347  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  71.08 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  68.57 
 
 		 251 aa  334  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  67.76 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  63.45 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  63.45 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  60.16 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.41 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  55.78 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  49.8 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  51.81 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  52.42 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  254  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  51.81 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  51.81 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  47.39 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.4 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  46.99 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  48.8 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  46.59 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  48.8 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  46.31 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  46.72 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  48.8 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.72 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  48.8 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.2 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  51 
 
 		 247 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.56 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  50.81 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  46.99 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  51.01 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  47.39 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  47.39 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  48.78 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  235  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  46.59 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  45.42 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  45.6 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  48.78 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  48.61 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  48.61 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  48.61 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  49.2 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>