125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3163 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  53.5 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  39.53 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  37.91 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  37.28 
 
 		 347 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  35.18 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  33.21 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  38.43 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  36.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  36.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  36.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  31.91 
 
 		 331 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  31.99 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  34.13 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  29.52 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  29.52 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  29.52 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  34.49 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  31.11 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  32.53 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  33.92 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  32.16 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  32.16 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  36.81 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  32.16 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  32.47 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  32.47 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.88 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.88 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.04 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  33.89 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  32.91 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  33.18 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  33.47 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  34.46 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  34.46 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  31.87 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  31.87 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  33.14 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  28.31 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  31.32 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  33.62 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  30.63 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  34.91 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  31.62 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.64 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  32.69 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  32.69 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  30.06 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  28.82 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  43.96 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  32.69 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  33.64 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  32.37 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  30.89 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  31.08 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  30.45 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.12 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  31.38 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.48 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  31.86 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  33.07 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  32.98 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  28.23 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  30.06 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  28.66 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  27.75 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.93 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  28.97 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  32.95 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  26.39 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  31.78 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  29.66 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01230  hypothetical protein  31.79 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  27.86 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  33.8 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03080  hypothetical protein  31.43 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  28.62 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  30.09 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  31.88 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  26.67 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  26.05 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  31.61 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>