More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3147 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  100 
 
 		 135 aa  258  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  63.49 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  60.63 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  60.63 
 
 		 138 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  58.02 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  56.25 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  53.23 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  55.73 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  53.44 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  58.46 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  51.56 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  55.22 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  55.56 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  56.92 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  51.43 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  51.91 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  52.46 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  53.79 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  49.23 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  47.2 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  53.03 
 
 		 164 aa  129  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  53.66 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  53.79 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  53.54 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  46.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  52.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  52.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  52.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  53.79 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  50.79 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  48.28 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  53.57 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  45.31 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  48.31 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  53.21 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  48.12 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  50 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  42.22 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  44.53 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  43.18 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40.32 
 
 		 195 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  42.52 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  42.42 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  32.87 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  37.88 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.12 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  33.86 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  39.37 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  40.16 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.86 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  40.32 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  36.72 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.88 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  35.97 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  40.15 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  42.64 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  45.98 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  38.38 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>