More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3042 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
492 aa  957    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  46.05 
 
 
423 aa  293  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  44.68 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  45.76 
 
 
425 aa  266  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  40.46 
 
 
415 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  42.6 
 
 
428 aa  259  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  39.12 
 
 
389 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
412 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  39.9 
 
 
431 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  38.26 
 
 
412 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  40.31 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  36.83 
 
 
406 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31 
 
 
684 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  28.89 
 
 
393 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  37.8 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.71 
 
 
631 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  26.32 
 
 
464 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  34.55 
 
 
683 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.6 
 
 
486 aa  93.2  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.74 
 
 
1079 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.71 
 
 
705 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
409 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 
634 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
705 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 
426 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.83 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.53 
 
 
451 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  32.64 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  32.19 
 
 
708 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  23.99 
 
 
612 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.11 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.34 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.52 
 
 
716 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.24 
 
 
1087 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.24 
 
 
1087 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26.98 
 
 
648 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  33.96 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  28.21 
 
 
687 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  28.47 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 
649 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.24 
 
 
1100 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.38 
 
 
708 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  32.51 
 
 
644 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  34.36 
 
 
853 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.48 
 
 
961 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.42 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  30.14 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  31.71 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  28.96 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  35.02 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  27.14 
 
 
754 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 
455 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.98 
 
 
637 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.07 
 
 
572 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  24.83 
 
 
536 aa  77  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  26.55 
 
 
397 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.67 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.36 
 
 
543 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  32.86 
 
 
315 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 
361 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  28.14 
 
 
396 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  33.15 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.34 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  31.8 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.64 
 
 
706 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.73 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.58 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  33.95 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.57 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.66 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.12 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  30.36 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.51 
 
 
590 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.08 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.27 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  29.69 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 
715 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.85 
 
 
678 aa  73.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  26.64 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  28.89 
 
 
630 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.37 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.65 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.2 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  25.29 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.19 
 
 
606 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.35 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  30.04 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  24.59 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0330  hypothetical protein  46.15 
 
 
112 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
574 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.73 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>