More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3024 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 314 aa  630  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  70.83 
 
 		 308 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  70.06 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  68.59 
 
 		 315 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  65.3 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  67.64 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  69.58 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  70.87 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  64.86 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  65.2 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  64.84 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  64.84 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  64.52 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  62.74 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  63.49 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  63.69 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  62.81 
 
 		 327 aa  384  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  65.16 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  63.41 
 
 		 310 aa  384  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  61.46 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  60.45 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  61.39 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  60.83 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  65.5 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  60.7 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  65.59 
 
 		 319 aa  355  5.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  59.62 
 
 		 306 aa  353  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  58.01 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  61.22 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  59.55 
 
 		 312 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  58.2 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  56.96 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 		 306 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.14 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  44.97 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.02 
 
 		 301 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 303 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  45.98 
 
 		 305 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  41.94 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  41.94 
 
 		 305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 313 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  41.94 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  45.83 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  44.09 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  43.59 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 		 298 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.83 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  46.77 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  45.34 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  49.07 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  43.45 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  40.65 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.88 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  42.58 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  40.65 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>