More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3010 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 610 aa  1147    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  58.92 
 
 		 585 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  58.61 
 
 		 585 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  58.71 
 
 		 583 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  56.79 
 
 		 567 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  54.08 
 
 		 593 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  56.37 
 
 		 569 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.86 
 
 		 592 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  56.79 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  53.65 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  56.48 
 
 		 580 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  53.48 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  52.21 
 
 		 580 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  50.78 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  50.52 
 
 		 579 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  51.74 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  53.17 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  51.18 
 
 		 584 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  51.45 
 
 		 574 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  52.41 
 
 		 578 aa  429  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  48.84 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  51.86 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  51.86 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  46.6 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  51.86 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  47.36 
 
 		 590 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  46.97 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  47.8 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  48.47 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  48.39 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  47.57 
 
 		 592 aa  369  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  48.27 
 
 		 580 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  47.3 
 
 		 612 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43.43 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 562 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 558 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.05 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 554 aa  290  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 594 aa  290  7e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 559 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 		 529 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  29.69 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.57 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.83 
 
 		 580 aa  283  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.37 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.29 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.34 
 
 		 554 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 		 589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.43 
 
 		 570 aa  274  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  27.95 
 
 		 567 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 		 523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  26.95 
 
 		 551 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 565 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.39 
 
 		 608 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 547 aa  263  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 605 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  29.32 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 557 aa  261  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 558 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  37.17 
 
 		 554 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 558 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.21 
 
 		 565 aa  259  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.81 
 
 		 555 aa  259  8e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.56 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.22 
 
 		 583 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.22 
 
 		 579 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 572 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.04 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.22 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 557 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 556 aa  257  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 579 aa  257  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.05 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.63 
 
 		 552 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 552 aa  256  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.46 
 
 		 554 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.87 
 
 		 557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  26.67 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  27.43 
 
 		 559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  27.43 
 
 		 559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>