174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2998 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  100 
 
 		 778 aa  1447    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  37.02 
 
 		 794 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  36.2 
 
 		 772 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  36.42 
 
 		 771 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  45.18 
 
 		 747 aa  202  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  23.19 
 
 		 799 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  40.14 
 
 		 815 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  24.25 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  36.97 
 
 		 616 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.8 
 
 		 775 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  32.43 
 
 		 953 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.3 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.39 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  32.41 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  29.35 
 
 		 937 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  36.3 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  40.21 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  28.92 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  27.37 
 
 		 898 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  27.94 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  28.43 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  28.43 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  28.43 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  28.43 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.45 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.97 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  28.92 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.94 
 
 		 466 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.94 
 
 		 466 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  29.5 
 
 		 466 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  43.37 
 
 		 450 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.31 
 
 		 512 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  42.05 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  38.64 
 
 		 539 aa  55.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  41.03 
 
 		 512 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.89 
 
 		 342 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  29.52 
 
 		 325 aa  55.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  30.36 
 
 		 502 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 		 417 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  40.66 
 
 		 552 aa  55.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 		 417 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  33.63 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  28.57 
 
 		 877 aa  54.3  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  29.08 
 
 		 518 aa  54.3  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.1 
 
 		 309 aa  54.3  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  35.61 
 
 		 319 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  42.86 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.98 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  30.34 
 
 		 282 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  38.2 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  39.33 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  39.33 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  30.53 
 
 		 678 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  41.03 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  41.77 
 
 		 518 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  38.96 
 
 		 503 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.64 
 
 		 547 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  42.39 
 
 		 534 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  25.99 
 
 		 322 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  36.08 
 
 		 291 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  39.33 
 
 		 417 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  32.68 
 
 		 575 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  36.26 
 
 		 472 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.36 
 
 		 542 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  26.7 
 
 		 447 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  34.48 
 
 		 461 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  30.71 
 
 		 519 aa  51.6  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  31.64 
 
 		 309 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.86 
 
 		 313 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  26.7 
 
 		 447 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.84 
 
 		 550 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.98 
 
 		 515 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  36.96 
 
 		 563 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  37.27 
 
 		 674 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  29.39 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  26.7 
 
 		 481 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.38 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  37.61 
 
 		 944 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  34.55 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.33 
 
 		 550 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  32.89 
 
 		 308 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  34.04 
 
 		 550 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.36 
 
 		 557 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.36 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  34.75 
 
 		 558 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  31.3 
 
 		 1247 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  37.08 
 
 		 408 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  31.36 
 
 		 552 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  35.96 
 
 		 408 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  35.96 
 
 		 408 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  33.33 
 
 		 526 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  36.84 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  37.37 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  43.33 
 
 		 563 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  38.64 
 
 		 603 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  35.83 
 
 		 506 aa  48.5  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  35.96 
 
 		 384 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  35.96 
 
 		 384 aa  48.5  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>