More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2922 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  66.1 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  66.1 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  65.75 
 
 		 307 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  45.08 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  45.21 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  52.29 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.84 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  50.68 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  50.17 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  49.83 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  50.87 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  50.17 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  51.06 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  50.51 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  51.57 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.16 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  49.67 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  49.66 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.18 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.87 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  50.34 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  50.17 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  49.13 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  49.48 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  49.48 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  49.48 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  49.66 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  47.65 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  49.82 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.97 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  47.02 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.07 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  46.55 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  49.32 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  44.56 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  38.31 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.58 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  37.88 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  36.99 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.22 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  41.89 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  39.16 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.43 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  35.93 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.83 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.22 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  42.09 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.1 
 
 		 303 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.55 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.43 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  47.14 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  28.82 
 
 		 286 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  40.88 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.39 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.6 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.88 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.49 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>