More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2914 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  72.39 
 
 		 586 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  62.05 
 
 		 581 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  62.59 
 
 		 582 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  62.32 
 
 		 581 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  61.4 
 
 		 582 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 611 aa  1191    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  66.91 
 
 		 582 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  62.41 
 
 		 585 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  66.67 
 
 		 583 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  66.55 
 
 		 582 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  68.48 
 
 		 610 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  67.7 
 
 		 573 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  66.55 
 
 		 582 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  64.32 
 
 		 573 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  58.85 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  62.33 
 
 		 592 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  61.33 
 
 		 694 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  58.56 
 
 		 580 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  55.97 
 
 		 602 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  55.7 
 
 		 602 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  49.27 
 
 		 663 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  48.92 
 
 		 678 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  46.8 
 
 		 664 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  52.37 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  56.08 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  47.44 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  52.29 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  51.7 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  57.85 
 
 		 525 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  44.72 
 
 		 639 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  44.95 
 
 		 671 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  48.19 
 
 		 662 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  48.39 
 
 		 651 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  43.28 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  41.35 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  44.2 
 
 		 523 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  40.99 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  42.23 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  41.82 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  41.82 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.75 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  43.96 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  39 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  41.29 
 
 		 580 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  39.38 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  41.9 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  42.13 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  42.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  42.56 
 
 		 603 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  40.35 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  39.77 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  41.68 
 
 		 505 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  40.35 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  40.35 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  41.49 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  41.76 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  40.4 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.97 
 
 		 606 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  40.16 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  40.16 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  41.4 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  43.54 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  41.2 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  39.76 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  39.92 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  39.66 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  41.99 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  41.99 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  39.89 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  47.1 
 
 		 593 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  38.88 
 
 		 530 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  42.15 
 
 		 538 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  38.96 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.32 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.32 
 
 		 657 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  40.52 
 
 		 659 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  40.73 
 
 		 661 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  42.12 
 
 		 659 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  41.61 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  39.25 
 
 		 661 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.09 
 
 		 551 aa  349  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  40.53 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  40.55 
 
 		 698 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  43.45 
 
 		 572 aa  346  6e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  39.31 
 
 		 556 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  39.55 
 
 		 606 aa  343  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 		 637 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  39.13 
 
 		 567 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  39.64 
 
 		 656 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.55 
 
 		 676 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  41.76 
 
 		 661 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  36.66 
 
 		 609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  39.29 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  41.31 
 
 		 673 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  38.83 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>