More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2869 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  63.61 
 
 
799 aa  1019  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1066  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1048  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  63.57 
 
 
792 aa  1043  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  64.71 
 
 
790 aa  1051  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.96099e-05  hitchhiker  4.14181e-07 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  64.4 
 
 
792 aa  1056  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  64.4 
 
 
792 aa  1055  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  63.29 
 
 
795 aa  1053  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  52.23 
 
 
806 aa  831  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  63.3 
 
 
794 aa  1048  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1051  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  64.54 
 
 
796 aa  1030  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  63.74 
 
 
799 aa  1018  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  52.43 
 
 
803 aa  775  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  63.78 
 
 
798 aa  1009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  62.93 
 
 
799 aa  1021  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
800 aa  1019  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  64.71 
 
 
789 aa  1038  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.37182e-05  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  66.67 
 
 
791 aa  1080  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63384e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  64.16 
 
 
792 aa  1056  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  64.4 
 
 
792 aa  1055  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  63.3 
 
 
794 aa  1048  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  66.92 
 
 
791 aa  1083  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  63.3 
 
 
794 aa  1048  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  67.57 
 
 
792 aa  1088  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  62.33 
 
 
798 aa  1041  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  63.19 
 
 
795 aa  1050  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.63208e-07  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1066  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  49.94 
 
 
799 aa  756  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
799 aa  1016  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  64.37 
 
 
784 aa  1023  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  66.07 
 
 
790 aa  1069  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  63.51 
 
 
801 aa  990  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
799 aa  1016  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  64.54 
 
 
796 aa  1034  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  52.41 
 
 
812 aa  764  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  63.82 
 
 
799 aa  1006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
812 aa  1016  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
799 aa  1016  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  56.43 
 
 
798 aa  857  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  66.92 
 
 
791 aa  1084  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  51.4 
 
 
811 aa  775  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  52.39 
 
 
803 aa  829  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  63.92 
 
 
803 aa  1038  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  67.05 
 
 
790 aa  1079  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  64.37 
 
 
789 aa  1047  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  64.4 
 
 
792 aa  1056  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  62.5 
 
 
801 aa  993  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1043  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  63.44 
 
 
799 aa  1016  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  51.59 
 
 
821 aa  790  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  66.97 
 
 
787 aa  1078  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  63.69 
 
 
792 aa  1044  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  64.28 
 
 
792 aa  1053  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  63.52 
 
 
792 aa  1035  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  49.94 
 
 
799 aa  756  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  63.26 
 
 
795 aa  1014  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  64.67 
 
 
797 aa  1035  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  66.15 
 
 
790 aa  1068  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  64.54 
 
 
796 aa  1034  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  66.12 
 
 
789 aa  1058  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  52.91 
 
 
804 aa  806  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.71715e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  63.82 
 
 
792 aa  1038  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  48.29 
 
 
812 aa  791  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  53.18 
 
 
812 aa  835  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  66.88 
 
 
790 aa  1042  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  45.73 
 
 
760 aa  658  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  63.08 
 
 
786 aa  967  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
810 aa  1638  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  52.95 
 
 
790 aa  847  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  63.6 
 
 
790 aa  1048  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  53.6 
 
 
799 aa  822  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  64.08 
 
 
792 aa  1040  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  54.99 
 
 
803 aa  871  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  53.28 
 
 
839 aa  865  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  70.67 
 
 
800 aa  1143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  55.23 
 
 
837 aa  889  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  52.23 
 
 
806 aa  841  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  65.04 
 
 
792 aa  1070  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  65.04 
 
 
792 aa  1070  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  63.83 
 
 
792 aa  1035  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  51.89 
 
 
809 aa  836  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  63.13 
 
 
797 aa  1012  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  63.26 
 
 
795 aa  1014  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  63.38 
 
 
801 aa  1027  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  64.28 
 
 
792 aa  1054  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  63.61 
 
 
801 aa  1025  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  49.87 
 
 
814 aa  739  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  64.92 
 
 
792 aa  1067  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  50.89 
 
 
805 aa  796  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  5.80674e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  64.62 
 
 
790 aa  1072  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  53.55 
 
 
803 aa  832  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  50.89 
 
 
793 aa  818  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  53.01 
 
 
832 aa  865  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  53.28 
 
 
839 aa  865  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  64.5 
 
 
789 aa  1064  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  6.30455e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  65.35 
 
 
788 aa  1031  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  64.4 
 
 
792 aa  1055  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  53.55 
 
 
803 aa  832  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  64.79 
 
 
792 aa  1064  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>