86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2801 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 161 aa  303  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  57.79 
 
 		 177 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  57.79 
 
 		 177 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  57.79 
 
 		 177 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  56.13 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  57.62 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  52.23 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  49.32 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  43.4 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  47.95 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  49.62 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  45.91 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  42.77 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  43.71 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  44.6 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  45.89 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  41.06 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  43.95 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  40.67 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  43.31 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  41.77 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  38.67 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  26.88 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  27.88 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  25.16 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  25.81 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  25.17 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  25.17 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  36.25 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  25.17 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  25.17 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  30.67 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  25.17 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  25 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  24.53 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  24.7 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  26.75 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  28.05 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36.23 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  23.12 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  35 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  41.51 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 684 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 667 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  32.48 
 
 		 401 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  40.74 
 
 		 673 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.29 
 
 		 663 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  37.84 
 
 		 405 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 656 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 215 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.48 
 
 		 350 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 204 aa  42  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 206 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  41.51 
 
 		 662 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 745 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  38.71 
 
 		 399 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  36.52 
 
 		 778 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 215 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  30.65 
 
 		 567 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  31.82 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 		 664 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.71 
 
 		 650 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  38.78 
 
 		 541 aa  40.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  37.5 
 
 		 578 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.8 
 
 		 332 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>