More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2800 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 387 aa  695    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  58.45 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  61.01 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  56.73 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  60.74 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  60.74 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  55.03 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  60.7 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  59.95 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  56 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  56.7 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  53.17 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  58.45 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  57.22 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  58.01 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  56.76 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  55.56 
 
 		 395 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  57.39 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  50.53 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  53.35 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  56.8 
 
 		 415 aa  259  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  50.67 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  37.75 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.63 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.8 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.23 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.97 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.97 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.23 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.23 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.23 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.5 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.5 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.72 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  32.72 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.72 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.72 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.46 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.72 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.46 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 757 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 		 586 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.91 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  33.14 
 
 		 585 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  32.35 
 
 		 585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 		 782 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 586 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 741 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 		 747 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 664 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 585 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  32 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  26.7 
 
 		 741 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 567 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 745 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 656 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 654 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 671 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 673 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 771 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  30.05 
 
 		 648 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 666 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  30.05 
 
 		 648 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  30.05 
 
 		 648 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  30.75 
 
 		 649 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 657 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 567 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 659 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 674 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 662 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.16 
 
 		 720 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 567 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  29.79 
 
 		 648 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.24 
 
 		 670 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 668 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 777 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 636 aa  86.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  29.14 
 
 		 666 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>