56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2776 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
487 aa  970    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  42.78 
 
 
414 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  38.93 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  39.79 
 
 
415 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  39.78 
 
 
429 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  43.44 
 
 
407 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  40.19 
 
 
404 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  40.21 
 
 
450 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  40.21 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  40.57 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  40.69 
 
 
377 aa  226  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  36.09 
 
 
452 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  36.7 
 
 
422 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  41.49 
 
 
794 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  38.01 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  37.7 
 
 
442 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.05 
 
 
407 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  38.12 
 
 
430 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  36.41 
 
 
418 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  34.48 
 
 
428 aa  213  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  39.67 
 
 
414 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  38.13 
 
 
542 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  36.08 
 
 
418 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  34.81 
 
 
423 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  34.84 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  39.15 
 
 
646 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  35.31 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  35.09 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.09 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  35.09 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  34.48 
 
 
425 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  35.1 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  34.8 
 
 
422 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  35.16 
 
 
416 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  34.77 
 
 
423 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.4 
 
 
425 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  35.09 
 
 
421 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  33.74 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  33.94 
 
 
421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.55 
 
 
421 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  34.55 
 
 
421 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  34.66 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  34.55 
 
 
423 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  36 
 
 
396 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.59 
 
 
425 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  38.35 
 
 
326 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  32.08 
 
 
422 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.38 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  31.66 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  25.19 
 
 
376 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  36.24 
 
 
220 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  31.51 
 
 
399 aa  93.6  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.61 
 
 
1375 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  37.93 
 
 
226 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>