85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2670 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
286 aa  575  1e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  66.06 
 
 
290 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  67.04 
 
 
298 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  64.16 
 
 
296 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  63.44 
 
 
292 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  63.67 
 
 
301 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  63.08 
 
 
288 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  63.16 
 
 
296 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  63.16 
 
 
296 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  63.16 
 
 
296 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  64.58 
 
 
286 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  60.97 
 
 
283 aa  353  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  59.85 
 
 
284 aa  348  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  58.7 
 
 
289 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  58.33 
 
 
289 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  58.33 
 
 
282 aa  343  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  62.36 
 
 
280 aa  342  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  63.1 
 
 
280 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  58.76 
 
 
284 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  62.37 
 
 
286 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  59.57 
 
 
292 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  56.27 
 
 
294 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  54.29 
 
 
281 aa  305  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  56.13 
 
 
279 aa  303  2e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  55.68 
 
 
285 aa  302  5e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  55.6 
 
 
283 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.87 
 
 
306 aa  285  6e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  51.96 
 
 
302 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  52.4 
 
 
283 aa  284  1e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  48.5 
 
 
301 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  46.99 
 
 
301 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  46.4 
 
 
282 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  50.55 
 
 
286 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  46.64 
 
 
296 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.64 
 
 
297 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  43.45 
 
 
269 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  42.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  44.64 
 
 
316 aa  221  1e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  38.49 
 
 
311 aa  201  1e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  36.47 
 
 
284 aa  147  2e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  30.18 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  29.31 
 
 
311 aa  115  7e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  26.69 
 
 
311 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  26.95 
 
 
329 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  29.73 
 
 
306 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  30.07 
 
 
306 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  29.27 
 
 
342 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  26.48 
 
 
334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  26.48 
 
 
334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  26.48 
 
 
334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  26.83 
 
 
330 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  28.75 
 
 
315 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  26.96 
 
 
301 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  27.67 
 
 
307 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  27.97 
 
 
307 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.72 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  27.61 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.87 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  28.17 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  25.77 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  26.64 
 
 
313 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  30.04 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  27.89 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  28.37 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.42 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  31.84 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  25.58 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.59 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  25.1 
 
 
312 aa  82.4  8e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  26.69 
 
 
316 aa  80.9  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  25.98 
 
 
312 aa  80.5  3e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.89 
 
 
310 aa  79.7  5e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  79.3  6e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  25.98 
 
 
310 aa  78.6  1e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  23.72 
 
 
312 aa  76.6  4e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  26.19 
 
 
304 aa  72  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  23.05 
 
 
318 aa  69.7  5e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  26.39 
 
 
353 aa  68.2  2e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.16 
 
 
319 aa  58.5  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.51 
 
 
276 aa  52  1e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  19.28 
 
 
276 aa  51.2  2e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  20.4 
 
 
276 aa  49.7  6e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  21.24 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  21.24 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  26.27 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>