More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2663 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 233 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  67.1 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  67.28 
 
 		 236 aa  287  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  62.3 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  61.76 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  67.46 
 
 		 233 aa  281  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  62.18 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  62.84 
 
 		 275 aa  272  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  59.84 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  65.96 
 
 		 228 aa  264  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  63.18 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 		 224 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  65.04 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  57.85 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  56.9 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  56.65 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  58.91 
 
 		 236 aa  227  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  59.24 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  56.78 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  53.94 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  56.8 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  52.72 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  51.52 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  52.3 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  56.52 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  53.56 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  57.28 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  43.28 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  40.34 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  39.59 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.79 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 199 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.92 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.37 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.36 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.65 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.13 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.18 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  26.77 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  34.41 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.07 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.15 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.87 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.87 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  24.87 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  26 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 448 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.46 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>