27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2657 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  38.84 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  35.63 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  35.06 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  35.71 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  34.26 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  36.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  33.88 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  37.14 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  32.77 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  33.82 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  34.96 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  33.6 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3402  hypothetical protein  32.93 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  0.301913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  32.71 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.06 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.429706  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5502  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.74 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5211  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.74 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5122  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.74 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3456  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.63 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5737  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.53 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.602445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>