75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2616 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  45.45 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  44.62 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  46.67 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  38.81 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  46.03 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  40.98 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  45 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  43.55 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  44.26 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  33.8 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  45.9 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  34.33 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  28.79 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  44.62 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  37.88 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  34.85 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  28.99 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  36.23 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  38.71 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  34.92 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  36.36 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  36.51 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  40.32 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  35 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  38.1 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  33.82 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  34.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  40.32 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  31.75 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  36.84 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  36.84 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  32.39 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  28.57 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  33.33 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  29.85 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  33.87 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  30.65 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  31.75 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0051  protein of unknown function DUF1458  41.67 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>