More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2573 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  50.59 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  50.59 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 183 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  52.41 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  49.09 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 		 174 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  45.68 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  47.34 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  42.33 
 
 		 165 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  42.77 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  38.29 
 
 		 191 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  40.69 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  39.01 
 
 		 182 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 159 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  41.84 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  40.79 
 
 		 156 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  35.21 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 146 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  36.43 
 
 		 169 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  35.97 
 
 		 169 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.43 
 
 		 158 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 139 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.41 
 
 		 161 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  37.88 
 
 		 179 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.46 
 
 		 153 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 144 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 144 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 144 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  35.88 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 144 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  32.62 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  85.1  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  35.21 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  37.68 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  36.69 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  34.39 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  35.97 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  34.51 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  36.13 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  31.39 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  36.8 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  40.38 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  37.1 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  36.76 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  36.76 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  36.76 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  36.03 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.4 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  32.8 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.43 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 159 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.51 
 
 		 159 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 159 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.88 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.88 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>