More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2490 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  100 
 
 		 294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  63.7 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  58.3 
 
 		 277 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  58.82 
 
 		 276 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  61.57 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  58.46 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  51.74 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  40.15 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  36.23 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  33.69 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  37.66 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  38.21 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.07 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  37.45 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  43.32 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  34.11 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  36.56 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  32 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  38.82 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  35.9 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  38.35 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  35.47 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  33.45 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.64 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.17 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.76 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.18 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  36.22 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.46 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  36.22 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.47 
 
 		 760 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  34.43 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  33.52 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  31.84 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  34.36 
 
 		 252 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.7 
 
 		 250 aa  96.3  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  35.33 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.4 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.97 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.96 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.13 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  38.8 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  37.91 
 
 		 345 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.52 
 
 		 335 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  28.66 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  35.91 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  34.87 
 
 		 354 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.19 
 
 		 378 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.71 
 
 		 387 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.65 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  37.08 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.72 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  37.5 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.02 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.79 
 
 		 753 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.68 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  36.67 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  37.36 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  34.59 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  37.36 
 
 		 390 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  32.22 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  32.62 
 
 		 335 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  28.62 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  35.33 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  36.36 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  30.51 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  30.51 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  31.15 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  29.19 
 
 		 400 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.65 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.65 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.65 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.65 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.32 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.6 
 
 		 735 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.2 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.37 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  33.75 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.58 
 
 		 727 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.71 
 
 		 751 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.76 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.37 
 
 		 728 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.76 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  33.13 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.77 
 
 		 738 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.77 
 
 		 738 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  26.69 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.18 
 
 		 728 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  35.35 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  34.53 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.14 
 
 		 737 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.5 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  32.95 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  31.61 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  32.95 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>