118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2484 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  100 
 
 		 461 aa  923    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  49.18 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  48.17 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  51.44 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  48.69 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  44.4 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  47.57 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  46.78 
 
 		 479 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  43.04 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  43.04 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  43.17 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  43.13 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  43.83 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  43.04 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  35.97 
 
 		 463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  36.4 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  35.34 
 
 		 765 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  35.94 
 
 		 464 aa  262  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  31.29 
 
 		 487 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  31.52 
 
 		 488 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  31.51 
 
 		 487 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  32.92 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  35.42 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  33.89 
 
 		 477 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  34.75 
 
 		 460 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  38.35 
 
 		 473 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  35.68 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  35.43 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.4 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  34.68 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  34.88 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  34.86 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  34.91 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  34.5 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  34.5 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  35.96 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  35.02 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  38.59 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  36.15 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  32.8 
 
 		 512 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  32.86 
 
 		 496 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  32.86 
 
 		 496 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  32.86 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  30.94 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  31.85 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.51 
 
 		 498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  30.08 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  31.7 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  30.83 
 
 		 537 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.62 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  28.47 
 
 		 914 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  30.19 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  29.64 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  31.52 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6365  Carotenoid oxygenase  34.18 
 
 		 408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  27.72 
 
 		 491 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  32.75 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  26.97 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  28.36 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  29.52 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  29.47 
 
 		 493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.78 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  29.23 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  28.3 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  28.78 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  31.83 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  27.94 
 
 		 495 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  28.93 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  28.93 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  28.87 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  30.89 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  28.66 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  27.69 
 
 		 507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  24.85 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  28.31 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  27.85 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  26.92 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  25.4 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.48 
 
 		 485 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  28.28 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  24.05 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  24.25 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.95 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.95 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  27.78 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  23.87 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  28.42 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  25.67 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  24.64 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  24.64 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  26.77 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43374  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.1 
 
 		 617 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>