279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2467 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  52.83 
 
 
281 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  50 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  53.76 
 
 
279 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  53.94 
 
 
274 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  54.95 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  54.95 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  54.95 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  49.63 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  36.67 
 
 
265 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  35.83 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  40.41 
 
 
276 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  35.83 
 
 
271 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  38.25 
 
 
282 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  33.08 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  34.13 
 
 
278 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  30.38 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.95 
 
 
287 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  33.2 
 
 
315 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  40.59 
 
 
279 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  36.07 
 
 
270 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  37.14 
 
 
274 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  36.8 
 
 
274 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  38.26 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  31.32 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  29.32 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  31.85 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  31.14 
 
 
296 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.91 
 
 
306 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  27.88 
 
 
307 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  30.94 
 
 
289 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  26.77 
 
 
307 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  36.86 
 
 
270 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  32.74 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  30.08 
 
 
292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  30.08 
 
 
292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  30.08 
 
 
292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  29.7 
 
 
292 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  33.74 
 
 
268 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  30.69 
 
 
303 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.34 
 
 
290 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  29.3 
 
 
284 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.67 
 
 
284 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  31.11 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  31.11 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30.97 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  30.97 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  30.97 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  30.97 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.53 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  34.66 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.11 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  31.17 
 
 
336 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.34 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  35.27 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.48 
 
 
276 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  33.04 
 
 
294 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  31.16 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  29.31 
 
 
299 aa  92  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  31.9 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  32.16 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.37 
 
 
332 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  30.04 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  32.69 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.08 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  32.57 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  28.17 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  25.51 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  31.4 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  30.77 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  36.16 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  29.11 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  21.01 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.11 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  32.45 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.25 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  28.8 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  26.19 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  28.82 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  27.34 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  37.09 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  34.38 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  26.12 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  28.09 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  30.81 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  31.6 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  38.66 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.56 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21275  predicted protein  28.73 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.67 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  26.46 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  28.17 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  24.19 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  29.33 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.39 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  37.82 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>