More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2462 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 		 875 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  50.43 
 
 		 927 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  49.95 
 
 		 922 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 861 aa  1635    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.64 
 
 		 899 aa  653    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 915 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.4 
 
 		 978 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.53 
 
 		 922 aa  581  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  31.62 
 
 		 542 aa  230  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  33.82 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  34.42 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  32.95 
 
 		 564 aa  222  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  33.4 
 
 		 544 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  35.73 
 
 		 556 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  31.08 
 
 		 546 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  31.08 
 
 		 546 aa  210  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  36.4 
 
 		 552 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  29.52 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  30.18 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  34.23 
 
 		 548 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  32.65 
 
 		 555 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  33.84 
 
 		 548 aa  200  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  28.87 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  30.21 
 
 		 563 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  28.7 
 
 		 571 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  28.43 
 
 		 574 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  28.48 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  28.86 
 
 		 614 aa  191  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  28.01 
 
 		 608 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  29.57 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  28.3 
 
 		 624 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  28.3 
 
 		 624 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  28.15 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  28.22 
 
 		 585 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  27.99 
 
 		 613 aa  187  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  28.75 
 
 		 628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  27.79 
 
 		 629 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  27.42 
 
 		 598 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 296 aa  161  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 294 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  27.49 
 
 		 581 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 294 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 294 aa  151  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 290 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  37.08 
 
 		 300 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  37.26 
 
 		 301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 		 301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 299 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 293 aa  146  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 300 aa  146  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 300 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 298 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 310 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  21.2 
 
 		 525 aa  142  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 291 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 296 aa  142  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 297 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 320 aa  140  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 339 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 339 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 318 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  30.42 
 
 		 308 aa  138  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 301 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 302 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 302 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 302 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 302 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 295 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 296 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  33.46 
 
 		 314 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 553 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 502 aa  112  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  29.56 
 
 		 564 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.46 
 
 		 510 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  30.37 
 
 		 510 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  30.15 
 
 		 510 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  27.92 
 
 		 564 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.21 
 
 		 550 aa  108  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  28.88 
 
 		 504 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  26.53 
 
 		 510 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  28.7 
 
 		 504 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  27.96 
 
 		 517 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  28.91 
 
 		 503 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.96 
 
 		 520 aa  104  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  24.79 
 
 		 504 aa  104  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  27 
 
 		 506 aa  104  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  28.31 
 
 		 506 aa  104  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  26.91 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  22.9 
 
 		 547 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>