216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2447 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  100 
 
 		 394 aa  770    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  59.04 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  55.42 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  56.58 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  54.43 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  58.22 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  50.81 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  47.24 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  48.79 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  41.87 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  43.16 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  40.58 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  38.5 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  40.83 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  40.81 
 
 		 444 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  35.6 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  41.3 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  41.9 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  41.79 
 
 		 418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  39.69 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  36.07 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.28 
 
 		 312 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  31.53 
 
 		 311 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  31.18 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  31.09 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.23 
 
 		 311 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.38 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  33.88 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  36.51 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  29.75 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  33.66 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.76 
 
 		 602 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  30.97 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.42 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.94 
 
 		 313 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  31.2 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  33.43 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  35.42 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.77 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  35.81 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  33.73 
 
 		 359 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.83 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  31.33 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  32.05 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.34 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  27.38 
 
 		 464 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  28.12 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  30.77 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  26.94 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  28.33 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.43 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.02 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  28.05 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  27.46 
 
 		 448 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  26.94 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  31.66 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  32.62 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  28.91 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  25.78 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.96 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  27.53 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  33.42 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  25.71 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.24 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.33 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  31.82 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  29.49 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.47 
 
 		 320 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  27.49 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.81 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  25.95 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  30.05 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  26.62 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  28.42 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  28.66 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  31.77 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  23.53 
 
 		 348 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.51 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.51 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.66 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  27.49 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.51 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.51 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.22 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.51 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  25.15 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.35 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.35 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  26.28 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.35 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  27.11 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.35 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.35 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  26.33 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  26.33 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  26.33 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  27.11 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.88 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  24.34 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>