55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2368 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  78.81 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.75 
 
 		 1048 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  41.73 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  39.02 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  40.22 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  44.09 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  33.05 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  45.88 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  45.57 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  44.05 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  39.13 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  41.94 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  41.94 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  39.29 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  45.16 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  33.61 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  47.37 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  39.51 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  34.33 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  40.45 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  36.3 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  43.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  43.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  43.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  43.18 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  37.17 
 
 		 1066 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  33.72 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  51.92 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  32.94 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  39.13 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  34.88 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  41.25 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.74 
 
 		 913 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  30.49 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  39.33 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 1079 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  35.53 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  35.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  32.56 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  35.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  29.27 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>