54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2353 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  100 
 
 
259 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  67.05 
 
 
259 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  58.69 
 
 
259 aa  295  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  56.76 
 
 
259 aa  292  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  45.21 
 
 
262 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  46.18 
 
 
324 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  46.95 
 
 
261 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  42.08 
 
 
317 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  49.58 
 
 
376 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  41.7 
 
 
257 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  44.44 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  41.7 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  42.97 
 
 
330 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  44.92 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  43.4 
 
 
397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  44.17 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  41.31 
 
 
256 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  42.13 
 
 
323 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  39.41 
 
 
254 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  37.74 
 
 
270 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  36.78 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  37.55 
 
 
318 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  32.3 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  32.05 
 
 
251 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  32.05 
 
 
251 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  32.17 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  33.47 
 
 
251 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  32.82 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  31.01 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  31.27 
 
 
251 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  38.02 
 
 
241 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  32.2 
 
 
252 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  32.2 
 
 
252 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  32.73 
 
 
247 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  32.41 
 
 
247 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  35.12 
 
 
305 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  29.28 
 
 
248 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  33.07 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  31.94 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  31.94 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  31.94 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  30.56 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  31.86 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  32.03 
 
 
327 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  29.63 
 
 
246 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  33.05 
 
 
261 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  29.57 
 
 
321 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  33.63 
 
 
268 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  28.57 
 
 
318 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  30.45 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  33.1 
 
 
132 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  31.69 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  31.96 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>