190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2347 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  100 
 
 		 333 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  68.77 
 
 		 333 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  68.47 
 
 		 333 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.46 
 
 		 332 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  68.26 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  64.97 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.3 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.49 
 
 		 364 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  65.66 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.56 
 
 		 332 aa  407  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  61.68 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  67.47 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.74 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.3 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.22 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.05 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  59.04 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.54 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  61.68 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  52.81 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.81 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.53 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  57.66 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  52.81 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.53 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  61.26 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.16 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.24 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.94 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.01 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.95 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.31 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.31 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.71 
 
 		 329 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.08 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.75 
 
 		 330 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  58.26 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.01 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.82 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.37 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  52.57 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.4 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  50.7 
 
 		 352 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  53.43 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  56.19 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.06 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  50 
 
 		 582 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.48 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.62 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.89 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.7 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.89 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  50.9 
 
 		 332 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.08 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  51.06 
 
 		 546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  49.09 
 
 		 583 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.84 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  48.79 
 
 		 583 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  48.79 
 
 		 583 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  48.79 
 
 		 583 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.04 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  48.79 
 
 		 583 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 		 583 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.82 
 
 		 333 aa  288  7e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  48.18 
 
 		 583 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  48.92 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  46.46 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  48 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  50.76 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  53.01 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  50.15 
 
 		 544 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  50.15 
 
 		 544 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  49.1 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  46.39 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  44.95 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  50.61 
 
 		 567 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  45.21 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  47.71 
 
 		 567 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  46.79 
 
 		 572 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  47.56 
 
 		 569 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  47.56 
 
 		 569 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  47.56 
 
 		 566 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  51.52 
 
 		 567 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  41.69 
 
 		 333 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.45 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.45 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  45.45 
 
 		 598 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  46.73 
 
 		 569 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  43.87 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  40.36 
 
 		 694 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.34 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  43.37 
 
 		 700 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>