234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2251 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 122 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  47.79 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  47.22 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  48.62 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  47.32 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  46.43 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  40.87 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  41.96 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  42.74 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  42.48 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  37.17 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  39.32 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  41.03 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  36.75 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  41.07 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  38.94 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  39.29 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  39.32 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  39.64 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  39.64 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  39.64 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  40.4 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  36.61 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  37.5 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  42.86 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  35.4 
 
 		 123 aa  84.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  38.39 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  40.74 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  39.32 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  36.89 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  42.59 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  41.03 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  35.04 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  42.86 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  42.86 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  41.67 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  34.51 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  36.28 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  36.28 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  45.54 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  36.28 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  35.04 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  40.18 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  39.82 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  39.81 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  38.39 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  33.33 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  38.39 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  36.61 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  34.43 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  33.04 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  36.61 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  36.17 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  30.09 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  38.18 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  29.2 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  25.89 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  25.89 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  37.27 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  38.18 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  38.18 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  38.18 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  29.06 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  31.73 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  26.79 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  31.82 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  39.8 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  34.38 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  27.18 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  27.45 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  34.65 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  26.73 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  41.54 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  27.16 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  26.21 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  26.73 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  28.92 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  28.92 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  38.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  26.73 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  39.74 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  38.46 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  25.24 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  24.72 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  28.92 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  38.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>