More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2233 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  63.59 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  53.33 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  52.57 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  50.54 
 
 		 184 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  48.3 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  50.84 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  49.43 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  48.26 
 
 		 182 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  48.28 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  48.26 
 
 		 187 aa  161  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  47.02 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  45.29 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  45.93 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  44.71 
 
 		 177 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  46.82 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  48.24 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  47.7 
 
 		 182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  47.34 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  43.53 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  44.71 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  47.98 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  45.29 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  44.77 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  41.95 
 
 		 182 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  42.94 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  44.91 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  43.93 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.73 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  42.26 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  47.13 
 
 		 176 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  45.4 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  42.53 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  41.52 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  42.44 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  38.82 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  36.42 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  40.85 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  42.61 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  42.44 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  42.35 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  38.15 
 
 		 174 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  42.2 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  41.52 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  39.41 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  42.44 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  40.59 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  40.76 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  40.85 
 
 		 178 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  34.88 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  35.29 
 
 		 175 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  36.42 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  40.7 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  41.71 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  43.6 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.88 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  42.55 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  38.89 
 
 		 177 aa  131  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  40.46 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  40.46 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  38.73 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  41.18 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.6 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.86 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.05 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  41.62 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.05 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.05 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  40.35 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  37.35 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.01 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  40.35 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  39.88 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.01 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.41 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  34.52 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  39.23 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  40.35 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  35.92 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  38.92 
 
 		 229 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.05 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  37.78 
 
 		 181 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  35.96 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  34.71 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  38.96 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  38.96 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  40.97 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  40.7 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  40.28 
 
 		 192 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  33.93 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  41.77 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>